Krevní kapilára ze sítnice - "optický řez". Červeně je značen kolagen 4. V levé horní části obrázku je snímek z jedné optické roviny (tj. jeden „řez“), při pohledu na větvenou kapiláru shora. Takto vypadá jednotlivý snímek z konfokálního mikroskopu. Pro 3D rekonstrukci obrazu je třeba následně přeostřit laserový paprsek na sousední optickou rovinu (nad nebo pod sejmutým obrazem) a sejmout nový snímek. Po pořízení více snímků (běžně cca 30-60) lze jednotlivé snímky „poskládat“ (seřadit nad sebe podle pořadí snímání). Potom získáme pro každý bod pozorovaného objektu konkrétní hodnotu jasu. Poté lze měnit libovolně směr/úhel pohledu a tím pádem je možné objekt zobrazit z libovolné strany (zorného úhlu) - všechna obrazová data ze všech virtuálních „řezů“ jsou totiž uložena v PC). Vše je znovu vypočítáno pro nově zvolený úhel pohledu (podle obrazových dat ze všech zobrazených vrstev) a následně je vygenerován pohled na objekt z námi zvoleného směru/úhlu. Tuto ukázku vidíme na sousedících dlouhých obrázcích: Hlavní obrázek je protnutý 2 zvolenými čárami, tyto čáry znázorňují imaginární řezy kapilárou ve směru shora dolů. Obrázek dole potom odpovídá pohledu z boku (zepředu) na imaginární řez v místě vodorovné čáry. Obrázek vpravo potom odpovídá pohledu z boku na imaginární řez v místě svislé čáry. Čáry protínající stěny kapiláry na bočních obrázcích znázorňují optickou rovinu (na ose z), na kterou byl laser zaostřen při pořízení snímku při pohledu shora.